I de fleste tilfeller forsvinner søvnapné ikke av seg selv, og tilstanden er kronisk. Spørsmålet om hvorvidt Søvnapné kan forsvinne av seg selv, forekommer ofte, men i praksis er det sjeldent. Sykdommen skyldes oftest mekaniske og anatomiske faktorer, som for eksempel innsnevring av luftveiene, slapphet i vevet i halsen eller overvekt. Disse årsakene forsvinner ikke uten inngrep, og derfor er kroppen ikke i stand til å „kurere” problemet på egen hånd.

Ubehandlet søvnapné fører til gjentatte episoder med oksygenmangel om natten, noe som belaster sirkulasjons- og nervesystemet. På lang sikt kan dette føre til høyt blodtrykk, kronisk tretthet og konsentrasjonsvansker. Pasientene merker ofte også en forverring av søvnkvaliteten og redusert yteevne om dagen. Hos noen kan en endring i livsstil føre til bedring, for eksempel vektreduksjon, redusert alkoholforbruk eller bedre søvnhygiene. Dette er imidlertid ikke en tilstrekkelig løsning i alle tilfeller.

Derfor er det i de fleste tilfeller nødvendig med spesialisert behandling som gjør det mulig å holde symptomene under kontroll og forebygge komplikasjoner.